三位一体宗教的传播过程
到了近代(清末至民国)，三位一体也被传入欧美多个国家。目前，法国、德国、美国、俄罗斯等国都有研究三位一体的专家学者。美国学者丁曾多次到莆田考察，调查三一学院，并撰写论文介绍。日本、马来西亚、印度尼西亚、新加坡、澳大利亚等国的专家学者也对学术研究感兴趣，有的还成立了三位一体的研究机构，发表了许多学术论文。尤其是日本，国内很多图书馆和高校都有上百卷的《树林全集》。学者铃木喜一郎研究了1934年三位一体在台湾省的传播，并在《台湾省旧风俗信仰》一书中有所介绍。当代学者的研究成果，如伊野忠雄、酒井忠雄等，也相当突出，影响很大。
在三位一体的传播过程中，林兆恩不断被追随者神化，从最初的讲师、老师、慈善家、隐士，逐渐演变为一个被众人膜拜的宗教领主。从明朝隆庆六年(1572)开始，一些信徒把林兆恩奉为神。明朝万历年间十五年(1587)，浙江方士傅銮画了一幅三教融合图，佯称:“近神见玉帝与天尊，所作乃三教融合之象，即今三教先生亦可传世供奉。”从此，林兆恩被称为三位一体的领袖。三一也开始从一个学术团体转变为一个宗教团体。林兆恩病逝后，三位一体立即分裂为两派，分别从各自的立场上继承和发展了林兆恩在学术和宗教两方面的理论遗产。一派从学术立场上继承了林兆恩的理论遗产。他们视林兆恩为有成就的理学家，公开抨击三位一体的宗教迷信活动。因为这个学派恪守三位一体的学术传统，只在知识界有一定的影响力。清朝入关后，就湮没无闻了。另一派从宗教立场上继承了林兆恩的理论遗产。林兆恩被任命为三位一体的领袖，三位一体被尊为“夏教”，进一步发展了三位一体的宗教哲学和伦理观，完善了三位一体的教规、仪式和教序体系。到明末清初，已成为横跨福建、江苏、浙江三省，远至北方的大教派。但在清朝禁止各种“邪教”的专制政策下，三位一体先后于康熙五十五年(1716)和乾隆五十三年(1788)被清政府两次取缔。经过两次打击，三位一体宗教由盛转衰。福建以外的三位一体宗教已经全部消失，只有莆田和仙游的三位一体宗教还能潜伏下来，在民间秘密流传。
19世纪中叶，清政府无暇顾及各种“邪教”活动，于是在民间流传了100多年的三位一体教，在海外移民的帮助下，于清末民初流行于莆田、仙游一带，并传入中国台湾省省、新加坡、马来西亚等东南亚国家，在当地华人世界流传至今。