难道法院的调解协议不能确认安置房的权利，推翻债权吗？

你不能。确权是指对房屋所有权证书和土地使用证的权利确认，是房屋产权登记的法定程序。当事人对房屋权属有争议的，可以向人民法院提起确认诉讼。所以不是法院的调解协议就能确认安置房的权利，推翻债权的。