新安江的主要支流。
率水，又称南港。发源于休宁县刘家尖，是丰源河；在翟店附近，汇美西苑和社河是大源河。至流口，会与小源河相遇，经祁门县扶风，与郎溪河相遇；重入休宁县，迎西溪河；过了冰池，会遇到杭溪河和桐梓溪；穿过江滩到上溪口会遇到沂源河；过了陈霞，又回到西河；通过第一个村庄，它将满足王茜河，并通过月坛龙湾颜回龚喜；然后经李鸿至唐嫣村附近流入屯溪地区，再经治中、溧阳至阳湖、横江流入新安江。主要河流全长148.2km，休宁县境内124.4km:流域面积1522平方公里，休宁县境内1391平方公里。它是休宁县最大的河流。源头为上溪口河岸，此处两岸山势陡峭，河道多呈弧形，河床基岩裸露，弧形凹滩发育，多为砂卵石沉积。河床相对稳定，一般河宽25-35米，河隙较大，具有建设中小型水电站的良好条件。从上溪口到陈霞河，地势逐渐开阔，河宽60 ~ 100米。从陈霞到寿村，河道入峡谷，山势险峻，河道曲折。月坛以下，河岸多为低坡丘陵，地势开阔，河道平缓。河宽120 ~ 200m，河漫滩发育。河岸由冲积层组成，不够稳定，植被较差，造成一定程度的水土流失。
横江，又名济阳水、东港、白鹤溪。丁白发源于黟县张玲，经玉亭东流入休宁县，在洞庭汇入洞庭河。过岩前，去兰都汇龙源河；芷阳村将是紫溪河；再去川湖万泉山一趟，夹源头水；继续向东流向万安镇，在福来桥与柳州河、罗松水汇合，在观音桥与元朗水汇合；经过千福，梅林附近，水就进入屯溪区。然后流经龙符新滩至阳湖，在阳湖与流水汇合，汇入新安江。主要河流全长69.8公里，休宁县城长度40.2公里。流域面积997平方公里，其中休宁县556平方公里。主要河流上游流经云起山，中下游两岸开阔，是秀屯盆地的主体部分，河流平缓，河漫滩发育良好。
连江也是新安江上游较大的支流，位于左岸，发源于黄山东麓，丰乐水、夫子水、布舍水、杨志水(连江)四条河流在歙县汇合后称为连江，在浦口汇入新安江。它是一个扇形的水系，练江的主干是杨枝水(又称练水)，先后接受袁爽和林溪的水。廉江长65公里，流域面积1.576平方公里，占新安江流域面积(在安徽境内)的24.4%。新安江左岸的支流主要有:
锦溪，在绩溪县铜坑岭西侧，发源于此，流经孔川，在棉溪口流入新安江。境内流经河西、李芳、红旗、洪飞、秦虹、淇县、北安、武都、安美、鸿基、棉溪、杨村等村，沿途接纳支流10条，右岸呈梳状布。主要河流全长46.8公里，流域面积125.80平方公里。境内长37.25公里，流域面积120.39平方公里，河宽4-25米，比降5.02‰，河床以砂卵石淤积。
昌熙，发源于天目山西侧，有昌和华两个源头。长源(主要源头)，从梁青峰到房建境内的山峰西麓，流经竹浦、三阳、七子里、苏村、李唐乡，到达石滩乡汇花园，沿途接纳百川、鹰坑、小溪、周传等河流；花垣，自绩溪县逍遥岩西南麓，流经石柱坑，再经水竹坑、西村、横溪、金山、庄川、上干、和政、下坑、金凤等村，到达石潭会昌院，沿途接受9条小溪。长与源头交汇，经长溪、丁滩至，汇入新安江。河流长70km，宽12-75m，比降4.19‰，流域面积452.40km2..长垣中村、花园西村以上河段岩石多裸露，碎石、卵石、砾石、漂石堆积，水流湍急。在中村和西村以下的河段，水流略缓，河床里堆积着沙子和鹅卵石。
洲源，有大有小。小源，出了白杨梢，上了路梢，流过井池，到岔口去接大宛；仙人从大源下山，流经周家村，在岔路口到达小源。大小源汇合后流经洽河、舞阳河，再流入大川新安江。河流长41.2km，宽40-48m，比降2.07‰，流域面积158.5km2..岔口以上河床岩石多裸露，下游多泥沙、卵石。
太平源，发源于本县青山尖，流经太平至新溪口，汇入新安江。该河长11公里，宽8.5-14米，比降18‰，流域面积24.15平方公里，河床为泥沙和卵石淤积。
新安江右岸的支流主要有:
小洲源发源于黄贝岭、潘玲、仙人涧，流经周晓、连萌、王米滩、林家坞，在小川汇入新安江。河道长19公里，宽15-19米，比降3.88‰，流域面积57.4平方公里。沿河有两座山和一个山谷，河床上沉积着沙子和鹅卵石，还有裸露的礁石。
街源，发源于白芨山的连岭、大风涧、十二山等山，流经南源口、长标口、户部口、小桥头、巨川至街口，汇入新安江。沿途接受长垣、长标、茶园、户部源、黄圩源、聚源的水。河道长43公里，宽30-34米，比降7.3‰，流域面积205.4平方公里。河床岩石多裸露，沉积有砂、卵石、大石头。产溪发源于休宁县杨修乡西部，主要位于屯溪区，流量19.1 km。河流流经禅川、龙符和黎阳乡，经西镇桥入水。
玉村河，发源于歙县石门乡，进入屯溪区洋湖乡上长湖头，从下恰洋进入新安江，长约6公里。
茶水，发源于休宁县黄元村，在屯溪区建中乡新江村小李入境，从唐王入水，境内流长不到3公里。五强溪源于安徽休宁县黄建。流经鱼枷、中州、淳安汾口，流入新安江水库。流域面积420平方公里，其中淳安境内面积221平方公里，干流长度41公里，水位落差642米，平均比降16.4‰，为山溪性河流。
林峰港起源于淳安、渠县、常山、华凯四县交界处的千里岗主峰磨尖，由白马溪、桐山溪两条溪流汇合而成。林峰港流经大树镇，然后流入新安江水库。流域面积292平方公里，干流长48公里，落差742米。这是一条山涧河流。
金仙溪又名东源港，发源于淳安大凌塔。在齐林桥上方由付强溪(瑶山溪)和梅川(元秋溪)汇合，然后注入新安江水库。齐林大桥以上流域面积397平方公里，其中富强溪流域面积203平方公里，干流长49公里。梅川河流域面积194平方公里，干流长36.6公里。
云源港，发源于安徽省淳安、歙县严故里交界处的泊船梢，向南流，经、、乡，注入乡新安江水库。流域面积249平方公里，干流长61公里，落差742米。
寿长江(溪)发源于建德长林乡大坑源村。水流经马尚、大通、老村溪，到达航头乡龚燕桥那小江溪、五龙溪，流入寿昌镇宋公桥童家溪，黄木墩、甘溪合并后流入罗通埠新安江。流域面积691平方公里，干流长64公里。流域内植被覆盖差，水土流失严重，汛期河水黄浊。
兰江是钱塘江最大的支流(曲江、兰江是钱塘江的干流)。发源于安徽休宁县青芝代尖北坡，上源称马进习，下称长山港，与江山港交汇处为曲江，沿途接受巫溪河、至夏河、灵山港等溪流，在兰溪与金华河交汇处为兰江。自南向北，到达建德三合乡，进入杭州，经过麻车、海洋、洋尾、南丰，到达梅城、南丰。兰江流域面积19350平方公里，干流长300公里，其中建德境内流域面积419平方公里，河段长23.5公里。
分水河有两个源头，昌化河和天目河，来自临安紫水镇紫溪村。主要源头昌化江，发源于安徽省绩溪县荆州西范蒸尖，海拔1.349米。在新桥乡西社务以西流入临安，经新桥、湖日、于涛、龙岗接颊口水，再经昌化、何桥等乡(镇)在资溪汇入天目河(福溪)。干流长72公里，流域面积1430平方公里，其中临安境内面积1376平方公里。天目河发源于西天目山，流经烧鹿、于谦、岩口、塔山、紫水等乡镇。其干流长57公里，流域面积788平方公里。昌化江和天目河交汇的那段叫分水河。分水河在朱茵乡河洲村入桐庐，经分水、横村，沿途接后溪、前溪等支流的水，在桐庐镇入富春江。分水河干流长165km，流域面积3430 km2。河道曲折，滩上布满急流，水位起伏剧烈。它具有山涧河流的特征，水力资源丰富。分水河曾是桐庐镇、分水、于谦、彰化的主要水路运输路线。由于水土流失严重，特别是1969年7月5日特大洪水后，河床抬高，除桐庐镇至横村尚同周闸河段外，其余河段均不再通航。