终极三国的所有剧情都是在16集之后引入的。
第17集
丢西姆喝了华佗调制的药水，性格变得积极开朗。他和关羽甜蜜地谈着恋爱。关羽虽然高兴，但代理校长董卓还是时不时骚扰他，坚持让关羽承担命题大学士的任务，硬是把命题大学士才能拥有的专属画笔塞给了关羽，但也引起了轩然大波。
多年来，曹家军都是担任命题大学士的职务，但今年由于董卓的安排，曹家军的名额被关羽取代，权益大受影响。虽然这不是关羽的愿望，但却引起了曹家军的强烈不满，随后他在五虎心病倒了。曹操会和五虎反目成仇吗？
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第十八集
为了解救丢西姆被董卓陷害辍学的故事，孙尚香用江东民间抓贼的方法抓到了真正的小偷。这一次董卓欣然同意，东汉书院的每一个学生都要通过这一关，他紧张极了。是谁偷了命题学院的御笔，栽在丢西姆的故事上？这种方法真的能抓到真凶吗？
眼看期中考试就要到了，先不提命题大学生是否与关羽、曹操、刘备、小乔、吴虎等有关。，都全力以赴复习功课，不然就要面临被学校开除的命运。为了帮助大家加油，细心的《丢西姆的故事》还做了一顿丰盛的晚餐作为补充，让大家可以精力充沛的去考场。这群兄弟能顺利通过期中考试吗？
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第19集
南匈奴大学突然向河东大学发起进攻，吕布被董卓派出救援，董卓受伤归来，在全校引起轩然大波。为了击退南匈奴，董卓在东汉大学士成立了动员平叛的志愿军，招揽武功高的学生，以保护河东大学士的安全，但全校没有人愿意主动报名。董卓不得不下令抽签组成志愿军，被抽中的人必须在三天内离开。当然，五虎是董卓最想要的人选。五虎会面临公平公正抽签出局的命运吗？
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第二十集
虽然抽签是在全校公证员的见证下进行的，但大家还是怀疑董卓会坏。赵云和刘备被抽中后，孙尚香再也忍不住了。他想停止这场不公平的游戏。不知道是紧张还是心里有鬼。慌乱中，他把手中的标志盒翻到了地上，所有的标志都掉在了地上。被一一放回签箱后，五虎其他人平安通过，但事后，蒋干也不见了踪影。彩票真的作弊了吗？
三天后，十二名被动员起来的防暴志愿者代表站在东汉书院的操场上，接受全体师生的欢送，一路将欢送队伍送上码头，直到船离开码头。不久后，曹操赶到，但阻止志愿军外出已经来不及了。他接到曹操的斥候报告说，派往河东大学平息混乱的学生都被消灭了。只要他们去了，就永远不会回来。
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第21集
一方面是因为曹家军用策略与南匈奴各大学结盟，另一方面是姜在帮助打败黄巾贼，还有五虎及时相救。东汉书院的义勇军虽然在atrix作战，但最终侥幸逃脱，安全返校。
但是，姜为什么会无缘无故地派兵来帮助呢？既然孙策没有指示周瑜出兵，为什么周瑜要亲自带队冒着风险攻打白波的金贼？
东汉书院暂时平静，大家都在上美术课。老师让大家画:我最喜欢的人。大多数没有爱人的人都是自己画自己的母亲。只有黄忠完全想不起来妈妈的样子。他的画纸一片空白，情绪低落。
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第22集
终于找到母亲的黄忠，万万没想到母亲竟是黄巾大学布拉克山分校的队长。这件事很快传遍了东汉书院，董卓想以勾结黄巾大学士的罪名把黄忠开除学籍。
刘备秀与孙尚香很投缘。虽然他一直在犹豫，但他真的能全身心投入爱情，谈一场打破时空秩序的恋爱吗？但此时刘备的未婚妻甘昭烈从老家来到东汉书院，完成了与刘备的婚约，她根本不认识甘昭烈。她该如何解决身份即将被发现的危机？还有，他将如何同时安抚孙尚香和甘昭烈？
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第23集
甘昭烈的出现给修带来了前所未有的危机。幸运的是，很宽容，给了秀足够的时间来处理这件事。而外表朴实美丽的甘昭烈，却在曹操家安顿下来，暂时有了栖身之所。然而，一些离奇的事情接连发生。先是阿香生来就患有一种怪病，然后小乔被毒死了。就在大家不知所措的时候，阿香发现了甘昭烈的可疑之处，直指甘昭烈是凶手，却让大家误以为他吃醋了，以至于会怀疑甘昭烈。
校园美少女丢西姆的故事脸上突然起了疹子，而且越长越大，同学们越担心疹子会传染，对丢西姆的故事保持了很大的距离。每个人都还在指指点点。吕布心疼丢西姆的命运故事，找关羽批评。他万万没有想到，这是丢西姆喝酒故事的副作用，让吕布更加气愤。他指责刘秀秀等人吸毒，让他失去了丢西姆的故事，但他也输了。
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第24集
故事丢西姆的性格因为喝了{变得很大}而变得乐观开朗，但是随之而来的副作用却害死了他。先是脸上起了一大片疹子，然后整个人就会昏迷。如果很严重，他会睡着。大家都很无奈，关羽也很心痛。但吕布对五虎的苦涩更为强烈。董卓建议他用针叉解救丢西姆的故事，吕布也间接陷入危机，因为针叉力量会把他带入结界的境界。
另一方面，为了平息白波黄金造反团的一再作乱，东汉学校联盟所属各区的学生会长都来到东寒书院参加联席会议，唯独江东书院学生会长孙策一人缺席。大家评论说，这么重要的会议，孙策绝对不能缺席。据江东书院传来的消息，孙策确实是从江东出发去参加东汉末年的会议，但是在途中突然失去了踪影。是生还是死？
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第25集
孙策生死未卜，于是大乔来到东汉书院批判关羽，指出关羽是杀人凶手。关羽在混战中确实对敌人进行了反击，只好默许。刘备和四虎听说后心情很沉重，孙尚香更加难过。但他们毕竟被疑惑震惊了，决定查明真相，让证据说话，再来判定关羽的罪责。怀着复仇的心，大乔转到东汉书院，在附近观察关羽。对于刘备来说，大乔的出现是纠结的，因为大乔其实是银色时空里铁时空和冷时空的一员，而孙尚香在刘备和大乔之间，敏感的意识到有一种不同寻常的气氛...
同时，董卓宣布任命吕布为校长特别助理，并积极介入东汉书院附近孙策失踪案的调查，这让曹操对董卓背后的目的产生了担忧。另一方面，银色时空因为蝴蝶效应开始出现，冥界的势力逐渐扩大。领导特意派了一个铁时空的将军来支援刘备。这位将军肩负了什么重任？
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第26集
为了调查孙策的失踪，去东汉书院学习的大乔对刘备秀很感兴趣。他不仅怀疑刘备是个垄断A货的混小子的传言，还当面说欣赏刘备秀音乐。
很明显，他对刘备秀有很深的感情，他不怕别人的眼光。在别人眼里，他极其担心自己会插手刘备秀和孙尚香的关系。
另一方面，小乔似乎对大乔的出现很不满意。谁都看得出来，小乔故意避开了大乔。两姐妹之间有什么不愉快的过去？会不会是因为感情纠葛？
丢西姆为了救关羽而求见董卓的故事。董卓自然不会放弃再次陷害关羽的机会。他想让关羽继续练针叉，身体自然会恢复。不过，看吕布的情况也不简单。五虎虽然和刘备有所犹豫，但目前也无能为力，只好按照董卓说的去做。关羽最后会不会像吕布一样？
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第27集
一直暗恋小乔的曹操终于有了行动，但还是敢偷偷摸摸，怕小乔发现，有心理压力。他送花，织毛衣，想做能让小乔开心的事，但又不敢在小乔面前承认。结果小乔误以为赵云为他做了这些事。本来就对赵云有意思的小乔，现在认定是两情相悦，让赵云很尴尬，也让曹操很尴尬。当年追丢西姆故事经验丰富的关羽，鼓励曹操勇敢表白。就算没有结果，他至少努力过~ ~曹操真的会向小乔表白吗？小乔喜欢赵云还是曹操？
河东大学发生了财政危机，董卓在纠结如何填补这个大窟窿。没想到丢西姆的故事掉进了陷阱，因为收取的课时费里有假币，他要受到惩罚和赔偿。金额高达7000万元。吕布出面帮丢西姆的故事还回去，丢西姆的故事直接拒绝了。吕布大怒，发誓绝不放弃丢西姆的故事。他的眼睛里还闪着紫色的魔光，令人望而生畏。为了缓解丢西姆故事中的危机，五虎等人不断追查假币的来源。真的是董卓设计的陷阱吗？还是另有其人？
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第28集
曹操终于鼓起勇气向小乔告白，但小乔逃走了，这让曹操相当伤心和失落。而这段突如其来的恋情，让小乔陷入了不愉快的过去。他和周瑜之间发生了什么？乔总是避开大乔。这和大乔有关吗？最后，小乔真的能走出感情的伤害，接受曹操的爱吗？
阿香要回江东，他的父亲孙坚坚持要阿香嫁给袁绍，但他与刘备秀的爱是如此之深。他们将如何面对即将到来的你将去哪里？
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第29集
一场突如其来的地震，把一直在铁时空养病的真实的刘备带回了银时空。慌慌张张地追着真正的刘备来到银色时空，想把刘备失踪的消息告诉秀。没想到，真正的刘备早已先发制人，暗中突袭秀，希望这个A货刘备永远消失，他取代原来在大家心目中的位子。
这一片混乱让五虎和阿香看得发呆。有时候真刘备出现了，有时候刘备秀出现了。面对如此大的差异，大家只能解读为:大哥还在为被戏弄的事件生气。
然而，一旦真正的刘备出现，秀只能按照时空的顺序，乖乖地回到铁时空。他一一告别了阿香和他的兄弟们，告别了银色时空里的一切~ ~ ~
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第三十集
黄巾贼猖獗。表面上看，董卓找了五虎平息乱局，但实际上这只是他的包装，因为他要五虎讨伐黄巾大学士布拉克山分校第六支队，也就是黄忠母亲率领的黄巾贼。很明显他想惩罚五虎。面对董卓教主的调令，芜湖和刘备秀一下子陷入了家庭和任务的两难！他们试图说服黄的母亲投降，但黄的母亲反驳说。上过东汉书院的富人是怎么知道黄巾书院穷人家的苦的？母亲黄和芜湖在互相保守的情况下开战。没想到吕布在后面等着收割现成的果实，想把大家都杀了~ ~ ~
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第31集
五虎、刘备修、黄妈妈被推上刑场，被判行为不检。曹家军和蒋秘密集结，企图抢劫俘虏。董卓也不示弱。吕布带领防御队招致命，激战中出现了一位不速之客。原来是的未婚夫袁绍，领兵都督。袁绍接管了行刑仪式的控制权，连董卓都要靠一边闪，但袁绍是对的。
关羽并不知道自己因为练了一手好叉而逐渐妖魔化，对误伤黄忠深感愧疚。同样在妖魔化的吕布找到关羽一起打天下，告诉关羽他们两个都只剩一年可活了。绝望中的关羽决定弃武，以免误伤兄弟，再次滥杀无辜。
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第32集
为了解救被妖魔化的关羽，刘备修想起了身处铁器时空的叶思仁曾用洗魂歌帮于霞洗去恶灵，于是央求刘侠的爷爷帮忙教他如何洗魂。但是，洗魂歌可以洗去关羽的魔性，但也会让关羽失去武功，武功盖世的关羽内心感到不安。还有刘灿北秀是如何向银石空的人解释他是如何得到救关羽的方法的？
曹操在天庭和人间听到教主解除王允通缉令的喜讯，众人欢迎王允回到东汉书院。董卓怎么会就此罢休，干脆把所有人都处死来保住东汉书院院长的宝位？《伊利亚特》能挡住董卓和吕布的神功吗？
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第33集
刘备修从白银时空的爷爷那里得到了安魂法，一心一意的修炼，所以一定要帮关羽恢复武功。没想到，安魂曲的旋律引发了董卓和吕布的魔力，他们与刘备秀等人展开了战斗。为了保护关羽，让刘备秀彻底发挥，四虎几乎献出生命保护兄弟。关羽见此，不舍兄弟为他牺牲，故安魂曲中断。
第二天，后遗症出现，中断的安魂曲让关羽迅速衰老，让所有人心疼不已。只剩一年时间的关羽，因为安魂曲，即将更快结束自己的生命。
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第34集
王允校长高高兴兴回到东汉书院，董卓当然不甘心。虽然他已经作为下级政府被纳入内阁，但他仍然没有放过那些一直反对他的人。他把吕布绑在透明的水缸里，水缸是水母炸弹，解开炼条的钥匙就在水里。关羽不愿意放弃吕布，坚持要营救他。他们也受到关羽友情的鼓舞，联手营救吕布。他们把水母的毒液吸进自己的身体，毒液引起的电流让所有人都感到非常痛苦。当孙尚香和刘备秀看到它的时候，他们同时大叫起来。孙尚香为什么会明白呢？他和刘备修将如何互相解释呜是什么，嗯？
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第35集
刘备故里的朋友邹靖突然来访，刘备修措手不及。他几乎不得不戴刘海。好在甘昭烈开道，这位好朋友却不安好心。和刘备一样，他只是卓君的一个小混混。为了钱，他绑架了孙尚香，袁绍带领袁家军前来救援。他还嘲笑刘备修只是结交一些卑微的朋友来让阿香受苦。不愿意羞辱自己的大哥，五虎向袁绍挑战，以证明大家有能力共同保护孙尚香的安全。双方约定，输的一方放手。代表出战的关羽意外输给了袁绍。。。
孙尚香的二哥孙权带着父亲孙坚的遗愿，希望孙尚香回到江东。东汉书院炸弹事件后，大家都认为东汉书院不再是一个安全的地方。阿香真的会和孙权、袁绍一起回江东吗？
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第36集
东汉书院终于恢复平静，但办学经费全部被削减。为了渡过危机，王允总裁与董卓对决，发表了三国中最精彩最有说服力的演说。原来说话也是一种武器。
在王允的极力劝说下，董卓第一次感到失落。原来朋友还是老的~
另一方面，董卓假装配合袁绍铲除宦官，却眼睁睁看着外戚和宦官互相争斗，乘虚而入。与此同时，内阁大规模改组，马洛塔取代袁绍出任校尉。愤怒的袁绍，情场失意，拥有三国最好最强大家庭背景的袁绍终于要爆发了~马上号召其他18高校讨伐董卓，一场大战马上开始。
趁着这个混乱的机会，吕布带着凤仙部队冲进了皇宫。历史上记载的只有一年寿命的吕布亲手杀了义父董卓吗？
在这混乱的世界局势中，三国第一魔术师左慈终于出现，教会了关羽绝技的真谛，还带来了青虹和紫电。
在刘备的苦苦哀求下，世界第一把吉他蓝虹紫电第一次展现了震撼三国的魅力。
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第37集
董卓上台后，废除了全校联盟，禁止学生上课。王允因此去长安找小学同学董卓商量求情。没想到一人之下，万人之上的董卓不顾过往，对王允残忍至极。曹操、吴虎等人听到王允总统失踪的消息后，都怒不可遏，发誓要为王允总统报仇。
另一方面，被董卓出卖，失去校尉官职的袁绍，号召除东汉书院之外的其他17院校讨伐董卓。董卓派出十万大军，最高级别的魔战。关羽能马上学会左慈教的武功对付董卓吗？而贝得到左慈的宝蓝彩虹紫洗去董卓的魔性？
为什么五虎会在决战时刻突然自相残杀？丢西姆的故事，他本不该加入与董卓的战斗，为什么又出现在战斗中？小乔在为谁哭泣？
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第38集
董卓消失后，他的权力崩溃了。袁绍以狄咸为丞相，全校所有的学校都恢复了运转，大家都可以上学了。然而，就在五虎等人高高兴兴去上学的时候，却得到了一个坏消息。袁绍买下了东汉书院的校区，曹操必须在30天内找到新校区，否则东汉书院就废了。
这时，马超收到了一封转发的信，题为《东汉书院有救了》。根据线索，大家来到了卧龙岗。传说中的第一军事家诸葛亮真的能拯救东汉书院吗？周瑜和诸葛亮的第一次斗智会如何发展？面对赵云即将开战，连命都不会拼的周瑜，还有一直陪在他身边的总裁，小乔会如何面对自己的感情问题？
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第39集
当刘备第三次邀请孔明时，诸葛亮向刘备坦白，他的按摩和邮件都是假的，他没有办法挽救东汉书院。东汉面对废学危机，刘备这个假的，遇到了诸葛亮遇到了D.C.W .女修道院会不会暴露？深爱着丢西姆故事的关羽，对往事和丢西姆点点滴滴的故事记忆犹新。失去心爱的人，他会做出什么惊人之举？
另一方面，为了分化刘备和曹操，江东大学士们想以阿香为诱饵，诱骗刘备进入江东。郁亮将如何玩第二场智慧游戏？另外，当担心刘备的阿香准备离家出走时，被他的父亲孙坚拦住了。孙坚是刘备和孙尚香的又一个障碍还是帮助？
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第四十集
周瑜试图分化刘备和曹操的友谊，用美人计把刘备骗到江东，让分隔两地的大哥和大嫂终于可以相见。但是一直反对说孩子谈恋爱的孙坚会制造什么样的障碍呢？而刘备又将如何解释上次离开时写在阿香手上的“秀”字？
二少爷孙权得知刘备没有和江东结盟，于是派忠旺军追杀刘备...刘备有没有办法把阿香带走，让吴栋“赔了夫人又折兵”？
另一方面，袁绍正式弃用东汉书院的消息来自东汉书院。孤立无援的曹，想出办法救他吗？是什么让小乔决定离开东汉，回到江东开始新的生活？曹操、周瑜、小乔之间难解的爱情大战将开始正面交锋…
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第41集
虽然东汉书院凭借诸葛亮的强势运气意外借荆州楼，但曾经无比富有的曹操此时却几乎破产。东汉书院不仅缺师资，中午连半顿午饭都买不到。东汉书院该如何面对江东高校的不断打压？
少帝交给刘备的四万广Xi卫队，也被江东发现了。当曹操发现刘备实际上私下拥有一支军队时，刘备和曹操能经受住孙权的挑衅和分化吗？此外，刘备等人遭到伏击。敌人是谁？小乔把曹操的事告诉周瑜是我的事。曹玉巧的三角恋会有什么化学变化？诸葛亮偶然认识了一个神秘的笔友。这个人给东汉书院荆州分院带来的是福是祸？
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第42集
东汉书院虽然成立了荆州分校，但是因为代理校长曹操家破产，学校就剩下自己的资源了，大家都指望诸葛亮想想办法。解，诸葛亮被迫在厕所涂鸦墙上得到指示，循线找出关键词“质子”会给东汉书院带来希望？还是又一波灾难？
大乔带着刘备等人埋伏的问题来见孙权。她能找到真正的答案吗？而刘备和阿香这对恶业鸳鸯，究竟要面对什么样的二次分离问题呢？
孙权猛烈攻击小乔。这会不会让曹操和周瑜对小乔的争夺进入白热化阶段？此外，密谋反对孙权的王钟军队中的幽灵也招募了使者。是大乔吗？
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第43集
袁绍在得知孙坚打算手握国玺，自立为王，大动干戈设立吴栋书院后，愤然离开江东。但两人谈判失败，甚至袁绍与阿香的婚约也不翼而飞。袁绍不甘受辱，决定用尽一切办法得到阿香…
爱情温度刚刚上升的小乔和周瑜，因为东汉书院弃学主谋的爆发，恋情再次发生变化。再加上最近东汉书院荆州分院的没落，让曹操有些蒙了。谁想对曹操等人不好？而又看到了曹的光芒？
另外，在曹家亭外冒雨站了一夜的孙权，一天之内就能拿到大乔不是王钟军中内奸的证据？大乔能全身而退吗？
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